Δίπλα στον οικισμό του Τσικαλαριού, στο κέντρο του νησιού, είναι το Χαλκί ή Τραγαία, στο κέντρο του χωριού βρίσκεται η ενορία του, η Παναγία η Πρωτόθρονος που είναι αφιερωμένη στον Ευαγγελισμό της Θεοτόκου. Η ακριβής χρονολογία του ναού δεν είναι βέβαιη, κυμαίνεται μεταξύ 9ου και 10ου αιώνα και φαίνεται να λειτουργείται αδιάκοπα από το 1052, στοιχείο που προκύπτει από την εντοιχισμένη στη πρόσοψη επιγραφή ανακαίνισης επί Επισκόπου Λέοντος. Ο αρχικός ναός πρέπει να κτίστηκε τα παλαιοχριστιανικά χρόνια ως τρίκλητη ξυλόστεγη βασιλική και τη μεσοβυζαντιβή περίοδο ανακαινίσθηκε ως τρίκλιτος σταυροειδής με τρούλο. Το κυκλαδικό καμπαναριό προστέθηκε το 1713. Η σημερινή του μορφή ανήκει στο μεταβατικό σταυροειδή εγγεγραμμένο με τρούλο τύπο, με έντονες αναμνήσεις της βασιλικής. Πιθανότατα, η Πρωτόθρονη ήταν αρχικά ο ναός του Επισκόπου της Νάξου και μετά το 1083 η έδρα του Μητροπολίτη Παροναξίας.
